L’any 1873 l’edifici, que era propietat de la família Cors, es va convertir en el col·legi Sant Narcís. 

A principis del segle XX, arran d’unes ampliacions i transformacions finançades pels propietaris de la fàbrica Grober, es crea l’Ateneu Social Democràtic. Des de l’any 1922, la cèntrica localització de l’Ateneu va permetre que tant els obrers de la fàbrica com la població gironina gaudissin d’esdeveniments i activitats culturals de tota mena. L’edifici estava compost per una gran sala de ball, un cafè i un espai de tertúlia. També hi havia una sala dedicada a la música, en la qual assajaven els membres de l’Orfeó Cants de Pàtria. A la planta superior s’impartien formacions d’oficis i arts decoratives per als membres de l’Ateneu. 

L’esclat de la Guerra Civil estronca la vitalitat d’un edifici que havia esdevingut un pol d’atracció d’oci cultural. El 24 de maig de 1941 la institució va adoptar el nom de Fomento de Cultura i va transformar la gran sala de ball en el que avui coneixem com a Cine Moderno. El Modern es va adaptar als nous temps amb la dotació d’un gran vestíbul i la provisió de butaques de fusta, i es va erigir com un dels equipaments culturals pioners de la ciutat de Girona.

L’any 1976 va ser anomenat oficialment Cinema Modern. El 1979 es va inaugurar una sala annexa al mateix edifici del Modern, la sala B, pensada per acollir cinema clàssic o d’autor, fins i tot es va projectar cinema S i X, mentre a la sala gran es programaven les grans estrenes. 

Malauradament, l’any 1988 un gran incendi va cremar la pantalla de projecció, el teló i l’escenari de la sala gran. A mitjans dels noranta s’aprofita per remodelar la sala gran i adaptar-la a les necessitats tecnològiques, implementant el format d’àudio digital. 

El 1992 el Col·lectiu de Crítics de Cinema de Girona, mitjançant un acord amb l’empresa gestora del Cinema Modern, passa a programar a la sala B, que es bateja com a Cinema Truffaut. 

El 4 de febrer de 1999 la sala gran del Cinema Modern tanca les portes definitivament, mentre el Cinema Truffaut es consolida i manté la seva activitat. 

El 2001 l’Ajuntament de Girona decideix comprar l’edifici amb la intenció de reformar-lo i incloure’l a l’oferta d’equipaments culturals de la ciutat. El mal estat estructural de l’edifici va fer que el 2007 el sostre de la sala gran s’esfondrés. 

L’abril de 2019 es van iniciar les obres de remodelació d’El Modern amb l’impuls del Projecte d’especialització i competitivitat territorial de les indústries culturals i creatives de Girona i el seu entorn territorial, a través d’una inversió FEDER. La primera fase del projecte va finalitzar el maig de 2021, que sumà nous espais de treball per al sector cultural: un plató audiovisual, una sala de postproducció, la sala 2 del Cinema Truffaut, i acollí serveis de l’Àrea de Cultura de l’Ajuntament de Girona, com l’Oficina de Foment de les Arts o la Girona Film Office.

Després del tancament del Cinema Modern i de l’adquisició de l’edifici per part de l’Ajuntament, el Col·lectiu de Crítics de Cinema de Girona presenta la seva candidatura i guanya el concurs per a la gestió del nou Cinema Truffaut. L’any 2001, passa a formar part de la xarxa més important del cinema europeu, Europa Cinemas. També esdevé seu oficial de la Filmoteca de Catalunya a Girona. L’any 2015, juntament amb altres cinemes d’arreu de l’Estat espanyol, crea la xarxa CineArte, de la qual també forma part. 

Des de llavors, el Cinema Truffaut s'ha convertit en espai de referència per a l'estrena i la visibilització de pel·lícules amb marcat caràcter de cinema d’autor, independents i amb especial atenció a propostes europees. L'aposta per la versió original l'ha convertit en l'únic cinema de Catalunya, fora de la província de Barcelona, que projecta tots els seus films amb subtítols, respectant la llengua pròpia de cada obra.

Un projecte liderat per l’Ajuntament de Girona, cofinançat en un 50% pel Fons Europeu de Desenvolupament Regional (FEDER) de la Unió Europea, en el marc del Programa operatiu FEDER de Catalunya 2014-2020, i en un 25% per la Diputació de Girona.